Schema de proiectare și soluția lanțului de peptide polipeptide

I. Rezumat
Peptidele sunt macromolecule speciale, astfel încât secvențele lor sunt neobișnuite în caracteristicile lor chimice și fizice. Unele peptide sunt dificil de sintetizat, în timp ce altele sunt relativ ușor de sintetizat, dar greu de purificat. The practical problem is that most peptides are slightly soluble in aqueous solutions, so in our purification, the corresponding part of the hydrophobic peptide must be dissolved in non-aqueous solvents, Therefore, these solvents or buffers are likely to be severely inconsistent with the use of biological experimental procedures, so that technicians are strictly prohibited from using the peptide for their own purposes, so that the following are several aspects of Proiectarea peptidelor pentru cercetători.

Schema de proiectare și soluția lanțului de peptide polipeptide
În al doilea rând, alegerea corectă a peptidelor dificile sintetice
1.. Lungimea totală a secvențelor reglate în jos
Peptidele cu mai puțin de 15 reziduuri sunt mai ușor de obținut, deoarece dimensiunea peptidei crește și puritatea produsului brut scade. Pe măsură ce lungimea totală a lanțului peptidic crește peste 20 de reziduuri, cantitatea precisă a produsului este o preocupare esențială. În multe experimente, este ușor să obțineți efecte neașteptate prin scăderea numărului de reziduuri sub 20.
2. Scade numărul de reziduuri hidrofobe
Peptidele cu o mare predominanță a reziduurilor hidrofobe, în special în regiunea 7-12 reziduuri din terminalul C, provoacă de obicei dificultăți sintetice. Aceasta este văzută ca o combinație inadecvată tocmai pentru că se obține o foaie de ori B în sinteză. „În astfel de cazuri, poate fi util să se convertească mai mult de două reziduuri pozitive și negative sau să punem Gly sau Pro în peptidă pentru a debloca compoziția peptidelor.”
3.. Reglarea în jos a reziduurilor „dificile”
„Există o serie de Cys, întâlniți, arg și încercați reziduuri care, în general, nu sunt sintetizate cu ușurință.” SER va fi de obicei utilizat ca o alternativă neoxidativă la Cys.
Schema de proiectare și soluția lanțului de peptide polipeptide

În al treilea rând, îmbunătățiți alegerea corectă a solubilului în apă
1. Reglați terminalul N sau C
În raport cu peptidele acide (adică încărcate negativ la pH 7), acetilarea (acetilarea N-terminus, terminalul C menține întotdeauna o grupare carboxil liberă) este recomandat în special pentru a crește încărcarea negativă. Cu toate acestea, pentru peptidele de bază (adică încărcate pozitiv la pH 7), aminația (grupul amino liber la terminalul N și aminația la C-terminus) este recomandată în special pentru a crește încărcarea pozitivă.

2.. Scurtați sau prelungiți secvența

Unele dintre secvențe conțin un număr mare de aminoacizi hidrofobi, cum ar fi TRP, PHE, VAL, ILE, LEU, MET, TYR și ALA, etc. Când aceste reziduuri hidrofobe depășesc 50%, de obicei nu sunt ușor de dizolvat. Poate fi utilă prelungirea secvenței pentru a crește în continuare poli pozitivi și negativi ai peptidei. A doua opțiune este de a regla în jos dimensiunea lanțului peptidic pentru a crește poli pozitivi și negativi prin reglarea reziduurilor hidrofobe. Cu cât laturile pozitive și negative sunt mai puternice ale lanțului peptidic, cu atât este mai probabil să reacționeze cu apa.
3. Puneți într-un reziduu solubil în apă
Pentru unele lanțuri peptidice, combinația unor aminoacizi pozitivi și negativi poate îmbunătăți solubilitatea în apă. Compania noastră recomandă N-terminus sau C-terminus al peptidelor acide să fie combinate cu Glu-Glu. Terminalul N sau C al peptidei de bază a fost dat și apoi Lys-Lys. Dacă grupul încărcat nu poate fi plasat, ser-gly-ser poate fi plasat și în terminalul N sau C. Cu toate acestea, această abordare nu funcționează atunci când părțile laterale ale lanțului peptidic nu pot fi schimbate.