Peptidele care se penetrează celulelor sunt peptide mici care pot pătrunde cu ușurință în membrana celulară. Această clasă de molecule, în special CPP -uri cu funcții de direcționare, are promisiune pentru livrarea eficientă a medicamentelor către celulele țintă.
Prin urmare, cercetarea asupra acesteia are o anumită semnificație biomedicală. În acest studiu, CPP -urile cu diferite activități transmembranare au fost studiate la nivel de secvență, încercând să afle factorii care afectează activitatea transmembranică a CPP -urilor, diferențele de secvență între CPP -uri cu activități diferite și nonCPP și introduc o metodă pentru analiza secvențelor biologice.
Secvențele CPPS și NONCPPS au fost obținute din baza de date CPPSITE și diferite literaturi și peptide transmembrane (HCPPS, MCPPS, LCPP) cu activitate transmembraniană înaltă, medie și scăzută au fost extrase din secvențele CPPS pentru a construi seturi de date. Pe baza acestor seturi de date, au fost efectuate următoarele studii:
1, aminoacizii și compoziția structurii secundare a diferitelor CPP -uri active și nonCPP -urilor au fost analizate de ANOVA. S -a constatat că interacțiunile electrostatice și hidrofobe ale aminoacizilor au jucat un rol important în activitatea transmembranică a CPP -urilor, iar structura elicoidală și bobinul aleatoriu au afectat, de asemenea, activitatea transmembranică a CPPS.
2. Proprietățile fizice și chimice și lungimile CPP-urilor cu activități diferite au fost afișate pe planul bidimensional. S -a constatat că CPP -urile și nonCPP -urile cu activități diferite ar putea fi grupate sub unele proprietăți speciale, iar HCPPS, MCPPS, LCPPS și NONCPP -uri au fost împărțite în trei clustere, arătând diferențele lor;
3. În această lucrare, este introdus conceptul de centroid fizic și chimic al secvenței biologice, iar reziduurile care compun secvența sunt considerate ca puncte de particule, iar secvența este abstractizată ca un sistem de particule pentru cercetare. Această metodă a fost aplicată la analiza CPP -urilor prin proiectarea CPP -urilor cu activități diferite pe planul 3D prin metoda PCA și s -a constatat că majoritatea CPP -urilor grupate și unele LCPP -uri grupate împreună cu NONCPPS.
Acest studiu are implicații asupra proiectării CPP -urilor și înțelegerea diferențelor din secvențele CPP -urilor cu activități diferite. În plus, metoda de analiză a centroidului fizic și chimic al secvențelor biologice introduse în această lucrare poate fi, de asemenea, utilizată pentru analiza altor probleme biologice. În același timp, ele pot fi utilizate ca parametri de intrare pentru unele probleme de clasificare biologică și joacă un rol în recunoașterea modelului.
Timpul post: 2025-07-02