Peptidele care pătrund în celule sunt peptide mici care pot pătrunde cu ușurință în membrana celulară.Această clasă de molecule, în special CPP-urile cu funcții de țintire, este promițătoare pentru livrarea eficientă a medicamentelor către celulele țintă.
Prin urmare, cercetarea asupra acesteia are o anumită semnificație biomedicală.În acest studiu, CPP-urile cu activități transmembranare diferite au fost studiate la nivel de secvență, încercând să se afle factorii care afectează activitatea transmembranară a CPP-urilor, diferențele de secvență dintre CPP-urile cu activități diferite și Non-CPP-urile și să se introducă o metodă de analiză a secvențelor biologice.
Secvențele CPP și NonCPP au fost obținute din baza de date CPPsite și din diferite literaturi, iar peptidele transmembranare (HCPP, MCPP, LCPP) cu activitate transmembranară mare, medie și scăzută au fost extrase din secvențele CPP pentru a construi seturi de date.Pe baza acestor seturi de date, au fost efectuate următoarele studii:
1, Compoziția de aminoacizi și structura secundară a diferitelor CPP și NonCPP active au fost analizate prin ANOVA.S-a descoperit că interacțiunile electrostatice și hidrofobe ale aminoacizilor au jucat un rol important în activitatea transmembranară a CPP-urilor, iar structura elicoidală și înfăşurarea aleatorie au afectat, de asemenea, activitatea transmembranară a CPP-urilor.
2. Proprietățile fizice și chimice și lungimile CPP-urilor cu activități diferite au fost afișate pe planul bidimensional.Sa constatat că CPP-urile și NonCPP-urile cu activități diferite ar putea fi grupate sub unele proprietăți speciale, iar HCPP-urile, MCPP-urile, LCPP-urile și Non-CPP-urile au fost împărțite în trei grupuri, arătând diferențele lor;
3. În această lucrare, este introdus conceptul de centroid fizic și chimic al secvenței biologice, iar reziduurile care compun secvența sunt considerate puncte de particule, iar secvența este rezumată ca un sistem de particule pentru cercetare.Această metodă a fost aplicată la analiza CPP-urilor prin proiectarea CPP-urilor cu activități diferite pe planul 3D prin metoda PCA și s-a constatat că majoritatea CPP-urilor s-au grupat împreună și unele LCPP-uri s-au grupat împreună cu Non-CPP.
Acest studiu are implicații pentru proiectarea CPP-urilor și înțelegerea diferențelor în secvențele CPP-urilor cu diferite activități.În plus, metoda de analiză a centroidului fizic și chimic al secvențelor biologice introdusă în această lucrare poate fi utilizată și pentru analiza altor probleme biologice.În același timp, aceștia pot fi utilizați ca parametri de intrare pentru unele probleme de clasificare biologică și joacă un rol în recunoașterea modelelor.
Ora postării: 15-jun-2023